Ankama c’est aussi de nombreuses branches qui ont toutes des spécificités. Parmi celles-ci il y a Ankama Studio qui fût créée en 2003 et qui produit des jeux pour Ankama et pour d’autres sociétés. Puis Ankama Games à été créée en 2006 suite au succès de Dofus (2004) et développe depuis tout les jeux d’Ankama.
Ankama Editions à été créée en octobre 2006 suite aux refus de différents éditeurs de publier les premières BD. Ils publient des BD, romans, artbook et manga liés aux univers de Dofus et Wakfu mais aussi d’autres univers indépendants.
En 2007 ils créent Ankama Animations qui est la branche qui produit les films et séries animés. Elle sort sa première animation nommée Goultard le Barbare en 2007 mais se fait connaître par la série Wakfu en 2008. En 2010 Ankama animation est regroupé avec d’autres filiales d’Ankama toutes dédiées aux animations et au cinéma, dont un studio se trouvant au Japon. En 2016 sort le premier film d’Ankama animation intitulé Dofus, livre 1 : Judith, qui connaît un succès moyen sur le marché du film d’animation 2D français, avec seulement 90 000 entrées.
Ankama Products est une filiale chargée de créer et produire les jeux (non vidéo) et les produits dérivés des univers de Dofus et Wakfu. Ils ont notamment créé le jeu de figurines Krosmaster ou encore le jeu de cartes à collectionner Wakfu TCG en partenariat avec la société Upper Deck. En 2015 le dirigeant de la filiale Jérôme Peschard annonce vouloir quitter le groupe afin de fonder sa propre entreprise et est remplacé par Pierre-Henri Dupont. A partir de 2016 Ankama se met à produire des jeux de société indépendant de l’univers du Krosmoz par le biais de sa nouvelle filiale Ankama Board Games.
Plus tard Ankama rachète Kalmeo, une structure fondée à Lyon spécialisée en applications mobiles qui développe Dofuspocket et Dofus Arena Pocket, deux jeux mobiles. En 2014 ils rachètent également Wizcorp en 2014 une jeune société japonaise également spécialisée dans le développement de jeux mobiles.
Ankama compte aussi de nombreuses filiales radiées. Parmi elles Ankama Web est historiquement la première activité du groupe Ankama. Créée en 2001, Ankama web était une agence de communication interactive spécialisée dans les nouveaux médias, la création et la conception de sites internet et développait des sites et applications internet pour les professionnels. Cette filiale fut abandonnée en septembre 2012 suite à la difficulté qu’avait cette activité à percer.
Créée en 2009 Ankama Music était le pôle musique d’Ankama, chargée de l’édition et de la production de musique et d’effets sonores pour les projets d’Ankama et d’artistes indépendants. Le groupe est supprimé en janvier 2015 suite à un manque de succès.
Ankama comptait plusieurs filiales à l’étrangé. Ankama Japon à été créés en 2009 et s’occupait principalement d’animation, Ankama Canada ouvre en 2013 et créé le jeu Abraca et d’autres studios ouvrent à Singapour et à São-Paulo. Mais ont depuis été radiées.